Beide bedeuten schwarz, aber es scheint einen Unterschied in der Nuance zu geben - so praktisch immer, wenn zwei verschiedene Wörter (fast) dasselbe bedeuten. Ich habe den Eindruck, dass Ater eher in Richtung "trauerlich" und Niger "böswilliger" oder "leuchtend" ist.
Was bedeutet Ater??
Verb. Ater. zu senden, zu liefern.
Was ist schwarz im klassischen Latein?
Ater, Atra, Atrum: Schwarz (dunkel) (atriabilisch)